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    Trizol法提取RNA:從樣本前處理到操作步驟

    發(fā)布時(shí)間: 2024-02-28  點(diǎn)擊次數(shù): 655次

    一、實(shí)驗(yàn)原理:

    Trizol試劑的主要成分是苯酚,對細(xì)胞進(jìn)行裂解,使細(xì)胞中的蛋白質(zhì)以及核酸物質(zhì)解聚。苯酚雖然可以有效的使蛋白質(zhì)變性,但它不能全部抑制RNA酶的活性,因此Trizol中還加入了8-羥基喹啉、異硫氰酸胍、β-巰基乙醇等來抑制內(nèi)源和外源RNase(即RNA酶)。存放在Trizol 中的樣品可以在負(fù)八十保存半年左右。


    二、樣本材料及其處理方法:

    貼壁培養(yǎng)細(xì)胞

    1.吸出培養(yǎng)液,細(xì)胞用預(yù)冷的1×PBS清洗兩次。2. 吸出PBS洗液,然后每1×108-2×107的培養(yǎng)細(xì)胞中加入1 ml的Trizol,輕搖培養(yǎng)皿,確保溶液均勻分布于細(xì)胞表面。(可用細(xì)胞刮刀剝離細(xì)胞)


    2.吸出PBS洗液,然后每1×108-2×107的培養(yǎng)細(xì)胞中加入1 ml的Trizol,輕搖培養(yǎng)皿,確保溶液均勻分布于細(xì)胞表面。(可用細(xì)胞刮刀剝離細(xì)胞)


    3. 使用移液器反復(fù)吹打使細(xì)胞脫落,然后將內(nèi)含細(xì)胞的裂解液轉(zhuǎn)移至離心管中,再用移液器吹打直至裂解液中無明顯沉淀(溶液清亮)。


    4. 室溫靜置5-10分鐘后,再進(jìn)行后續(xù)的RNA提取操作。


    懸浮培養(yǎng)細(xì)胞

    1. 將懸浮細(xì)胞收集至離心管中,12000 rpm 4℃離心2分鐘,棄上清,用預(yù)冷的1×PBS清洗兩次。

    2. 向1×106-2×107細(xì)胞中加入1ml的Trizol。

    3. 用移液器吹打至裂解液清亮無明顯沉淀。

    4. 室溫靜置5-10分鐘后,再進(jìn)行后續(xù)的RNA提取操作。


    動(dòng)物組織、植物材料樣品

    1. 將準(zhǔn)確稱取的RNA提取樣品轉(zhuǎn)移液氮預(yù)冷的研缽中,用研杵研磨組織(研磨過程中需要不斷向研缽中補(bǔ)加液氮),直至研磨成粉末狀,然后向粉末中加入適量的Trizol并混勻。(針對柔軟易裂解的組織樣本,可以使用勻漿器加入適量Trizol進(jìn)行勻漿裂解。)


    2. 將上述混合液轉(zhuǎn)移至離心管中,用移液器反復(fù)吹打充分混勻。室溫靜置5分鐘,12,000 rpm 4℃離心5-10分鐘。


    3. 小心吸取上清液,移入新的離心管中,再進(jìn)行后續(xù)的RNA提取操作。


    三、操作步驟:

    (1)樣本前處理。

    (2)向上述裂解液中加入Trizol體積量1/5氯仿,充分混合(渦旋或用槍頭混勻)。室溫靜置15分鐘。

    (3)12000 rpm 4℃離心15分鐘。小心取出離心管,此時(shí)勻漿液分為三層,即:上清液(含RNA)、中間蛋白層及下層有機(jī)相。吸取上清液轉(zhuǎn)移至另新的離心管中。

    注:每管大概取 200-300 μl,此步驟非常關(guān)鍵,提出的RNA質(zhì)量好純度高即可。若吸取水相時(shí)吸到有機(jī)相會(huì)導(dǎo)致雙峰,A260/230特別低。

    (4)沉淀 RNA:向其中加入相同體積異丙醇,上下顛倒混勻。在-20℃放置10 min。12000 rpm 4℃離心10 min后棄去上清。

    (5)清洗 RNA:向沉淀中加入500 μl 預(yù)冷的無水乙醇,吹散沉淀洗滌RNA,洗滌兩次,12000 rpm 4℃離心后棄去上清。

    注:把沉淀彈起來,讓其懸浮在酒精中,然后放1-2min,讓酒精充分接觸沉淀,充分溶解有機(jī)試劑,然后再離心。

    (6)打開離心管,室溫干燥沉淀約5分鐘。

    注:不要離心干燥,否則RNA將很難溶解,如果殘留乙醇較多可延長干燥時(shí)間。

    (7)向離心管中加入20 μl DPEC水溶解RNA。將溶解后的RNA放入-80℃保存。

    注:如果提取的是組織樣本,溶解液可以多加點(diǎn)。

    (8)取2 μl進(jìn)行電泳。

    四、注意事項(xiàng):

    1. 防止RNA酶污染。

    • 戴好口罩,手套。
    • 全程最好在生物安全柜操作(根據(jù)實(shí)驗(yàn)條件)
    • 實(shí)驗(yàn)所涉及的試劑/溶液,尤其是水,必須確保RNase-Free。耗材均需要通過DPEC處理。

    2. 明確目標(biāo)。

    • 提取成功標(biāo)準(zhǔn)是RNA的質(zhì)量和純度,而不是得率。

    3. 測量結(jié)果:

    • A260/A280:1.8-2.2,若<1.8則表明有蛋白質(zhì)污染;

    • A260/A230:1.5-2.4,若<1.5則表明有明顯的有機(jī)物如糖、膚、苯酚的污染。

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